Akshata Murty sinh vào tháng 4 năm 1980 tại Hubli, Ấn Độ,[4][7] Murty được ông bà ngoại nuôi nấng khi cha bà N. R. Narayana Murthy và mẹ Sudha Murty làm việc để thành lập công ty công nghệ Infosys.[7][8] Mẹ bà là nữ kỹ sư đầu tiên làm việc tại Tata Motors, nhà sản xuất ô tô lớn nhất Ấn Độ lúc đó, rồi trở thành một nhà từ thiện.[9] Murty có một người em trai là Rohan Murty,[10] cả hai lớn lên ở Jayanagar vùng ngoại ô của Bangalore.[11] Ông bà ngoại của Murty là R. H. Kulkarni, một bác sĩ phẫu thuật, vợ ông Vimala Kulkarni là giáo viên.[12]

Thập niên 1990,[13] Murty theo học Trường trung học Nữ sinh Baldwin ở Bangalore, đến năm 1998 theo học ngành kinh tế và tiếng Pháp tại Đại học Claremont McKenna ở California.[14] Bà có bằng cấp về chế tạo quần áo của Học viện Thiết kế Thời trang & Kinh doanh,[7] và bằng MBA từ Đại học Stanford.[7]